期刊信息
主办:中国动物学会;中国科学院动物研究所
主管:中国科学院
ISSN:0250-3263
CN:11-1830/Q
语言:中文
周期:双月
影响因子:0.467105
数据库收录:
文摘杂志;北大核心期刊(1992版);北大核心期刊(1996版);北大核心期刊(2000版);北大核心期刊(2004版);北大核心期刊(2008版);北大核心期刊(2011版);北大核心期刊(2014版);北大核心期刊(2017版);农业与生物科学研究中心文摘;化学文摘(网络版);中国科学引文数据库(2011-2012);中国科学引文数据库(2013-2014);中国科学引文数据库(2015-2016);中国科学引文数据库(2017-2018);中国科学引文数据库(2019-2020);日本科学技术振兴机构数据库;中国科技核心期刊;期刊分类:生物学
期刊热词:
研究报告
成骨细胞特异因子2 基因家族的全基因组鉴定、(3)
【作者】网站采编
【关键词】
【摘要】表4 |Fasciclin 蛋白信号肽分析Table 4 |Fasciclin protein signal peptide analysis物种名称 信号肽数量 分泌蛋白数量 线粒体蛋白数量小鼠 2 1 1黑猩猩 2 2 0大鼠 4 3 1非
表4 |Fasciclin 蛋白信号肽分析Table 4 |Fasciclin protein signal peptide analysis物种名称 信号肽数量 分泌蛋白数量 线粒体蛋白数量小鼠 2 1 1黑猩猩 2 2 0大鼠 4 3 1非洲爪蟾 1 0 1斑马鱼 3 3 0人类 3 3 0鸡2 2 0中华鳖 未知 未知 未知
3 讨论 Discussion
成骨细胞特异性因子2 是一种高度保守的基质细胞蛋白[14],分子中包含一个特有的信号序列,结构分析显示属Fasciclin 家族。实验从比较基因组学角度出发,对成骨细胞特异因子2 Fasciclin 基因家族进行了详细的比较分析,并从Fasciclin 基因家族的保守结构、蛋白特性及系统发育关系进行系统的比较分析和归纳总结,为揭示该基因家族在生长发育中的功能和进化历史或演化规律提供重要参考。
通过Fasciclin 基因家族的保守结构来比较分析发现,该家族总共有3 个高度保守的motif,这3 个保守的motif 推测可能是主要的执行功能的结构域。
实验通过对Fasciclin 基因家族的蛋白特性分析发现,发现Fasciclin 蛋白家族的成员为偏酸性的亲水性蛋白,且结构稳定,同时该类蛋白的长度变化较大,范围为529-2 847个氨基酸残基,相应的理论分子量也差异较大,分子质量 kD。通过对Fasciclin 基因家族信号肽的比较分析,发现在小鼠中有一个可能为分泌蛋白,一个可能为线粒体蛋白,在黑猩猩中有2 个可能为分泌蛋白,大鼠有3 个可能为分泌蛋白,一个可能为线粒体蛋白,蟾中有一个可能为线粒体蛋白,在斑马鱼、人和鸡中,预测的分泌蛋白占
大多数,3 个物种中共有8 个可能为分泌蛋白。这就意味着Fasciclin 蛋白家族的成员在行使功能的过程中有其组织和器官的特异性。
表5 |Fasciclin 蛋白的生化特性Table 5 | Biochemical properties of Fasciclin proteins物种名称 基因名称 长度 分子质量(kD) 等电点 疏水性 不稳定指数 定位斑马鱼 DrGENSCAN 2 025 220.698 6.15 -0.289 44.44 Secretory pathway DrGENSCAN 1 008 111.575 7.31 -0.179 35.22 Secretory pathway DrGENSCAN 969 107.247 7.00 -0.074 35.62 Secretory pathway DrGENSCAN 566 61.997 6.96 -0.056 32.67 Secretory pathway DrGENSCAN 1 849 202.359 5.77 -0.189 41.42 Other location鸡GgGENSCAN 3 652 401.127 6.17 -0.246 45.04 Other location GgGENSCAN 2 044 225.241 8.33 -0.196 46.70 Other location GgGENSCAN 2 645 288.956 6.04 -0.292 37.17 Secretory pathway GgGENSCAN 2 536 281.903 7.11 -0.163 45.10 Other location人类 HsGENSCAN 2 587 277.368 5.99 -0.196 45.83 Secretory pathway HsGENSCAN 2 347 254.155 6.02 -0.275 41.69 Other location HsGENSCAN 710 77.511 6.48 -0.051 32.66 Secretory pathway HsGENSCAN 1 082 121.599 8.69 -0.273 41.00 Secretory pathway小鼠 MmGENSCAN 2 371 254.860 6.22 -0.111 41.89 Mitochondrion MmGENSCAN 2 062 224.820 6.53 -0.343 44.17 Other location MmGENSCAN 1 067 445.680 5.96 -0.300 39.63 Other location MmGENSCAN 597 64.919 5.64 -0.043 33.43 Other location MmGENSCAN 774 86.050 7.02 -0.134 33.85 Secretory pathway中华鳖 PsGENSCAN 924 100.708 6.41 -0.202 42.63 Other location PsGENSCAN 1 878 207.866 6.20 -0.217 44.52 Other location PsGENSCAN 2 608 285.136 6.75 -0.318 39.19 Other location PsGENSCAN 2 355 252.630 6.91 -0.169 43.34 Other location PsGENSCAN 1 016 113.51 5.59 -0.335 41.90 Other location黑猩猩 PtGENSCAN 2 677 287.475 5.95 -0.203 45.93 Secretory pathway PtGENSCAN 779 87.296 7.85 -0.173 36.06 Secretory pathway PtGENSCAN 2 343 253.457 5.96 -0.271 40.69 Other location PtGENSCAN 686 75.170 6.03 -0.184 39.44 Other location大鼠 RnGENSCAN 2 847 308.514 6.04 -0.106 46.63 Mitochondrion RnGENSCAN 2 216 241.154 5.98 -0.320 40.44 Secretory pathway RnGENSCAN 940 104.946 6.67 -0.200 35.44 Secretory pathway RnGENSCAN 861 94.590 7.31 -0.186 43.54 Secretory pathway非洲爪蟾 XtGENSCAN 1 655 182.386 5.54 -0.144 34.71 Other location XtGENSCAN 834 88.749 5.12 -0.107 39.92 Other location XtGENSCAN 723 80.029 6.26 -0.107 33.71 Other location XtGENSCAN 529 57.301 6.15 -0.372 48.01 Mitochondrion XtGENSCAN 971 107.819 6.05 -0.169 30.45 Other location
图2 |Fasciclin 蛋白的系统进化树Figure 2 |Phylogenetic tree of Fasciclin proteins
从Fasciclin 蛋白家族的系统发育关系分析发现,Fasciclin蛋白基因家族的基因具有严格的保守性,是主要的功能基因。整个进化树可以分为4 个进化分支,其中的2 个进化分支的基因具有更强的保守性,推测可能是主要的成骨细胞特异因子;其中一类则可能是两栖类、哺乳类和灵长类特有的成骨细胞特异因子;另外一个分支也具有较好的保守性,但是非洲爪蟾和小鼠在该进化分支中有2 个拷贝基因,推测这个进化分支对这两类物种起着重要的作用。在物种进化的过程中,该家族的基因并没有发生较大的变化,推测这类基因可能是重要的生长发育相关基因,这类基因的缺失可能会导致个体的死亡或导致物种的灭绝。
成骨细胞特异性因子2 在长骨的骨膜中表达,也在心脏、肾脏、皮肤和肺等许多其他组织和器官中表达[15-16],可作为临床生物标记物进行癌症、呼吸系统疾病、肾衰竭、肾损伤和心肌梗死等疾病的诊治[17-18]。研究该基因家族的进化历史或演化规律,对于研究物种的形成和演化,更好的服务于人类健康和研究具有重要的意义。
文章来源:《动物学杂志》 网址: http://www.dwxzzzz.cn/qikandaodu/2021/0128/458.html
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